Hierarchy For All Packages

Package Hierarchies:

• edu.claflin.finder,
• edu.claflin.finder.algo,
• edu.claflin.finder.algo.clustering,
• edu.claflin.finder.algo.jungutils,
• edu.claflin.finder.io,
• edu.claflin.finder.io.graph,
• edu.claflin.finder.io.graph.sub,
• edu.claflin.finder.log,
• edu.claflin.finder.logic,
• edu.claflin.finder.logic.communities,
• edu.claflin.finder.logic.communities.struct,
• edu.claflin.finder.logic.communities.struct.fast_greedy_struct,
• edu.claflin.finder.logic.communities.struct.walk_trap_struct,
• edu.claflin.finder.logic.comp,
• edu.claflin.finder.logic.cond,
• edu.claflin.finder.logic.cygrouper,
• edu.claflin.finder.logic.processor,
• edu.claflin.finder.struct

Class Hierarchy

• java.lang.Object
  • java.util.AbstractCollection<E> (implements java.util.Collection<E>)
    • java.util.AbstractQueue<E> (implements java.util.Queue<E>)
      • java.util.PriorityQueue<E> (implements java.io.Serializable)
        • edu.claflin.finder.struct.PrioritySet<T>
    • edu.claflin.finder.algo.jungutils.MapBinaryHeap<T> (implements java.util.Queue<E>)
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.AbstractGraph<V,E> (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.Graph<V,E>, java.io.Serializable)
    • edu.claflin.finder.algo.jungutils.AbstractTypedGraph<V,E>
      • edu.claflin.finder.algo.jungutils.UndirectedSparseGraph<V,E> (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.UndirectedGraph<V,E>)
    • edu.claflin.finder.algo.jungutils.SparseGraph<V,E> (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.Graph<V,E>)
  • edu.claflin.finder.algo.Algorithm (implements edu.claflin.finder.logic.processor.Processable<T,S>)
    • edu.claflin.finder.algo.BreadthFirstTraversalSearch
    • edu.claflin.finder.algo.BronKerbosch
    • edu.claflin.finder.algo.Bundle (implements java.beans.PropertyChangeListener)
    • edu.claflin.finder.algo.clustering.ClusteringAlgorithm
      • edu.claflin.finder.algo.clustering.FastGreedy
      • edu.claflin.finder.algo.clustering.GirvanNewman
      • edu.claflin.finder.algo.clustering.Walktrap
    • edu.claflin.finder.algo.ConnectedComponentsDFS
    • edu.claflin.finder.algo.DepthFirstTraversalSearch
    • edu.claflin.finder.algo.DijkstraShortestPath
    • edu.claflin.finder.algo.Kruskal
    • edu.claflin.finder.algo.MatrixPatternAnalyzer
    • edu.claflin.finder.algo.Prim
    • edu.claflin.finder.algo.ShortestPath
  • edu.claflin.finder.algo.ArgumentsBundle
  • edu.claflin.finder.logic.processor.BatchProcessor<T,S>
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.BetweennessCentrality<V,E> (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.EdgeScorer<E,S>, edu.claflin.finder.algo.jungutils.VertexScorer<V,S>)
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.BetweennessCentrality.BetweennessComparator (implements java.util.Comparator<T>)
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.BetweennessCentrality.BetweennessData
  • edu.claflin.finder.logic.communities.struct.BinarySearchTree<T>
  • edu.claflin.finder.logic.BronKerboschBipartiteUtils
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.CommonMatcher
    • edu.claflin.finder.algo.jungutils.JdkPattern.JdkMatcher
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.CommonPattern
    • edu.claflin.finder.algo.jungutils.JdkPattern (implements java.io.Serializable)
  • edu.claflin.finder.logic.cygrouper.Communicator (implements edu.claflin.finder.logic.cygrouper.CommunicationListener)
  • edu.claflin.finder.logic.communities.Communities
  • edu.claflin.finder.logic.Condition
    • edu.claflin.finder.logic.cond.BipartiteCondition
    • edu.claflin.finder.logic.cond.CliqueCondition
    • edu.claflin.finder.logic.cond.DirectedCliqueCondition
  • edu.claflin.finder.logic.cygrouper.CygrouperAssembler
  • edu.claflin.finder.logic.cygrouper.CygrouperEdge
  • edu.claflin.finder.logic.cygrouper.CygrouperNode
  • edu.claflin.finder.logic.cygrouper.CytogrouperMain
  • edu.claflin.finder.algo.DijkstraShortestPath.EdgeComparator (implements java.util.Comparator<T>)
  • edu.claflin.finder.struct.DisjointSet<T>
  • edu.claflin.finder.logic.Edge<D>
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.EdgeBetweennessClusterer<V,E>
  • edu.claflin.finder.logic.comp.EdgeWeightComparator (implements java.util.Comparator<T>)
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Functions
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Functions.ConstantFunction<E> (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.Function<F,T>, java.io.Serializable)
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Functions.ForMapWithDefault<K,V> (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.Function<F,T>, java.io.Serializable)
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Functions.FunctionComposition<A,B,C> (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.Function<F,T>, java.io.Serializable)
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Functions.FunctionForMapNoDefault<K,V> (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.Function<F,T>, java.io.Serializable)
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Functions.PredicateFunction<T> (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.Function<F,T>, java.io.Serializable)
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Functions.SupplierFunction<T> (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.Function<F,T>, java.io.Serializable)
  • edu.claflin.finder.Global
  • edu.claflin.finder.logic.Graph
    • edu.claflin.finder.logic.ConditionedGraph
  • edu.claflin.finder.logic.cygrouper.GraphAverageWeight
  • edu.claflin.finder.logic.cygrouper.GraphAverageWeightComparator (implements java.util.Comparator<T>)
  • edu.claflin.finder.logic.cygrouper.GraphSizeComparator (implements java.util.Comparator<T>)
  • edu.claflin.finder.logic.communities.struct.fast_greedy_struct.HeapNodeFG (implements java.lang.Comparable<T>)
    • edu.claflin.finder.logic.communities.struct.fast_greedy_struct.IndexedHeapNode
  • edu.claflin.finder.logic.communities.struct.walk_trap_struct.HeapNodeWT (implements java.lang.Comparable<T>)
  • edu.claflin.finder.logic.communities.struct.fast_greedy_struct.IndexedHeapQueue
  • edu.claflin.finder.log.LogUtil
  • edu.claflin.finder.Main
  • edu.claflin.finder.io.ManifestParser
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.MapBinaryHeap.ComparableComparator (implements java.util.Comparator<T>)
  • edu.claflin.finder.io.graph.NOABatchIO (implements edu.claflin.finder.io.graph.sub.GraphWriter)
  • edu.claflin.finder.logic.Node (implements java.lang.Comparable<T>)
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Pair<T> (implements java.util.Collection<E>, java.io.Serializable)
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Pair.PairIterator (implements java.util.Iterator<E>)
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Preconditions
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicates
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicates.AndPredicate<T> (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicate<T>, java.io.Serializable)
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicates.CompositionPredicate<A,B> (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicate<T>, java.io.Serializable)
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicates.ContainsPatternPredicate (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicate<T>, java.io.Serializable)
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicates.InPredicate<T> (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicate<T>, java.io.Serializable)
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicates.InstanceOfPredicate (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicate<T>, java.io.Serializable)
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicates.IsEqualToPredicate<T> (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicate<T>, java.io.Serializable)
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicates.NotPredicate<T> (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicate<T>, java.io.Serializable)
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicates.OrPredicate<T> (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicate<T>, java.io.Serializable)
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicates.SubtypeOfPredicate (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicate<T>, java.io.Serializable)
  • edu.claflin.finder.algo.Prim.DistanceRecord
  • edu.claflin.finder.algo.Prim.DistanceRecordComparator (implements java.util.Comparator<T>)
  • edu.claflin.finder.io.graph.SIFGraphIO (implements edu.claflin.finder.io.graph.sub.GraphReader, edu.claflin.finder.io.graph.sub.GraphWriter)
  • edu.claflin.finder.io.graph.SimpleGraphIO (implements edu.claflin.finder.io.graph.sub.GraphReader, edu.claflin.finder.io.graph.sub.GraphWriter)
  • edu.claflin.finder.logic.communities.struct.fast_greedy_struct.SparseMatrix
  • edu.claflin.finder.logic.communities.struct.TreeNode<T> (implements java.lang.Comparable<T>)
  • edu.claflin.finder.logic.communities.struct.TreeNodeInfo (implements java.lang.Comparable<T>)
    • edu.claflin.finder.logic.communities.struct.fast_greedy_struct.TreeNodeInfoFG
  • edu.claflin.finder.logic.communities.struct.fast_greedy_struct.VectorValue
  • edu.claflin.finder.algo.clustering.Walktrap.MutualConnectionsRecord
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.WeakComponentClusterer<V,E>

Interface Hierarchy

• edu.claflin.finder.logic.cygrouper.CommunicationListener
• edu.claflin.finder.algo.jungutils.EdgeScorer<E,S>
• edu.claflin.finder.algo.jungutils.Function<F,T>
• edu.claflin.finder.io.graph.sub.GraphReader
• edu.claflin.finder.io.graph.sub.GraphWriter
• edu.claflin.finder.algo.jungutils.Hypergraph<V,E>
  • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Graph<V,E>
    • edu.claflin.finder.algo.jungutils.UndirectedGraph<V,E>
• edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicate<T>
• edu.claflin.finder.logic.processor.Processable<T,S>
• edu.claflin.finder.algo.jungutils.VertexScorer<V,S>

Enum Hierarchy

• java.lang.Object
  • java.lang.Enum<E> (implements java.lang.Comparable<T>, java.io.Serializable)
    • edu.claflin.finder.algo.Algorithm.GraphSortOrder
    • edu.claflin.finder.algo.ArgumentsBundle.COMMON_ARGS
    • edu.claflin.finder.algo.jungutils.EdgeType
    • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Functions.IdentityFunction (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.Function<F,T>)
    • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Functions.ToStringFunction (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.Function<F,T>)
    • edu.claflin.finder.log.LogLevel
    • edu.claflin.finder.log.LogType
    • edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicates.ObjectPredicate (implements edu.claflin.finder.algo.jungutils.Predicate<T>)